Além do auxílio do PROEX (CAPES nível 6), os projetos desenvolvidos no PGMT recebem auxílio do IOC pelo Plano Estratégico e o Plano de Objetivos e Metas, a produção anual de cada laboratório é pontuada e revertida a uma porcentagem da verba institucional.
O Programa de Pós-graduação Stricto sensu em Medicina Tropical do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz) está credenciado, atualmente, com conceito 6 na Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes/MEC), considerado como excelência pela instituição. Os projetos científicos realizados no contexto do Programa estão voltados para a pesquisa, o desenvolvimento tecnológico e a inovação em saúde.
